Konversi EPI menjadi SCT

Memahami format file EPI dan SCT

Files EPI biasanya terkait dengan Bruker ParaVision MRI sistem dan berisi data Echo Planar Imaging. File-file ini menyimpan citra MRI mentah atau rekonstruksi, sering digunakan dalam penelitian pencitraan medis dan diagnosis.

File SCT, di sisi lain, adalah file Scanco Medical CT, umum digunakan untuk data micro-CT (computed tomography). File SCT menyimpan data gambar volumetrik dan metadata, terutama untuk analisis tulang dan jaringan dalam penelitian biomedis.

Kenapa mengonversi EPI ke SCT?

Mengonversi EPI ke SCT diperlukan saat Anda perlu menganalisis data MRI menggunakan perangkat lunak atau alur kerja yang dirancang untuk data micro-CT, atau saat mengintegrasikan dataset MRI dan CT untuk studi komparatif.

Bagaimana cara mengonversi EPI ke SCT

Konversi langsung antara EPI dan SCT tidak didukung secara native oleh sebagian besar perangkat lunak pencitraan, karena keduanya adalah format khusus. Alur kerja tipikal melibatkan mengonversi file EPI ke format yang lebih umum (seperti DICOM atau TIFF), kemudian mengimpor atau mengonversi format tersebut ke SCT menggunakan perangkat lunak Scanco atau alat yang kompatibel.

Perangkat lunak yang disarankan untuk konversi

• ImageJ/Fiji: Perangkat lunak pengolahan citra open-source yang dapat mengimpor file EPI (dengan plugin) dan mengekspor ke format seperti TIFF atau DICOM. Gunakan File → Open untuk memuat EPI, kemudian File → Save As → TIFF atau File → Save As → DICOM.
• Perangkat lunak Scanco Medical: Perangkat lunak proprietary yang dapat mengimpor stack DICOM atau TIFF dan mengekspor ke SCT. Gunakan File → Import untuk memuat format perantara, kemudian File → Export → SCT.
• 3D Slicer: Platform gratis dan open-source untuk informatika citra medis. Impor EPI (melalui konversi DICOM atau NIfTI), kemudian ekspor sebagai format yang kompatibel untuk konversi SCT.

Langkah-langkah proses konversi

1. Gunakan ImageJ/Fiji untuk membuka file EPI Anda.
2. Ekspor stack citra sebagai TIFF atau DICOM menggunakan File → Save As.
3. Buka file yang diekspor di Perangkat lunak Scanco Medical atau alat yang kompatibel.
4. Ekspor atau simpan data sebagai file SCT menggunakan File → Export → SCT.

Saran dan pertimbangan

• Pastikan orientasi citra dan ukuran voxel dipertahankan selama konversi.
• Periksa kehilangan data atau artifact setelah setiap langkah konversi.
• Konsultasikan dengan fasilitas imaging atau vendor perangkat lunak Anda untuk plugin atau skrip tertentu jika konversi langsung diperlukan.

Ringkasan

Meskipun tidak ada konverter EPI ke SCT satu langkah secara langsung, penggunaan ImageJ/Fiji dan Perangkat lunak Scanco Medical secara berurutan menyediakan alur kerja yang andal untuk mengonversi data MRI EPI ke format SCT untuk analisis micro-CT.