Konversi PIV menjadi STK

Memahami format file PIV dan STK

PIV files biasanya terkait dengan data Particle Image Velocimetry, sebuah teknik yang digunakan dalam dinamika fluida untuk memvisualisasikan dan mengukur pola aliran dengan melacak pergerakan partikel yang disemprotkan dalam fluida. File-file ini sering berisi data gambar berurutan atau bidang kecepatan yang telah diproses.

STK files adalah format rangkaian gambar milik proprietary yang dikembangkan oleh MetaMorph (Molecular Devices). Mereka umum digunakan dalam mikroskopi untuk menyimpan urutan gambar multi-frame atau multi-channel, sehingga cocok untuk data citra time-lapse atau z-stack.

Mengapa mengonversi PIV ke STK?

Mengonversi PIV files ke format STK berguna saat Anda perlu menganalisis atau memvisualisasikan urutan gambar yang diambil dari PIV dalam perangkat lunak mikroskopi canggih, seperti MetaMorph atau ImageJ, yang mendukung format STK untuk menangani data gambar multi-dimensi.

Cara mengonversi PIV ke STK

Konversi langsung dari PIV ke STK tidak secara native didukung oleh sebagian besar perangkat lunak, karena struktur file PIV dapat bervariasi. Alur kerja biasanya melibatkan ekstraksi urutan gambar dari file PIV dan lalu menyimpannya atau mengekspor sebagai tumpukan STK.

Perangkat lunak yang direkomendasikan untuk konversi

• ImageJ/Fiji: Alat pengolahan gambar yang sangat kuat, gratis, open-source yang banyak digunakan dalam pencitraan ilmiah. Mendukung baik membaca urutan gambar PIV (jika diekspor sebagai TIFF atau format serupa) maupun menulis file STK melalui plugin.
• Bio-Formats plugin: Plugin untuk ImageJ/Fiji yang memungkinkan impor dan ekspor berbagai format gambar ilmiah, termasuk STK.

Langkah-langkah konversi menggunakan ImageJ/Fiji

1. Ekspor data PIV Anda sebagai urutan gambar (misalnya TIFF) jika belum dalam format ini.
2. Buka ImageJ/Fiji.
3. Pilih File → Import → Image Sequence… dan pilih gambar PIV yang diekspor.
4. Setelah rangkaian gambar dimuat, pergi ke File → Save As → STK (memerlukan plugin Bio-Formats).
5. Pilih lokasi tujuan dan simpan file tersebut.

Tips untuk konversi yang sukses

• Pastikan gambar PIV Anda dalam format yang kompatibel (TIFF disarankan).
• Jika perangkat lunak PIV Anda mengekspor bidang kecepatan sebagai gambar, gunakan gambar tersebut untuk konversi.
• Pasang versi terbaru dari plugin Bio-Formats di ImageJ/Fiji untuk kompatibilitas terbaik.

Ringkasan

Mengonversi PIV files ke format STK paling baik dilakukan dengan mengekspor data PIV sebagai urutan gambar dan menggunakan ImageJ/Fiji dengan plugin Bio-Formats untuk menyimpan urutan tersebut sebagai file STK. Alur kerja ini memastikan kompatibilitas dengan alat analisis mikroskopi tingkat lanjut.