Konverter online gratis NBIB ke BIB

PubMed mengekspor referensi yang dipilih sebagai .nbib, sedangkan LaTeX, Overleaf, dan banyak reference manager menggunakan database BibTeX .bib. Mengonversi rekaman tersebut membuatnya dapat diedit dan digunakan dengan alur kerja sitasi BibTeX atau biblatex.

Apa itu format NBIB

NBIB adalah format sitasi bertag milik PubMed, yang juga disebut format teks MEDLINE atau PubMed. Format ini merupakan format rekaman teks biasa dengan kolom berlabel seperti PMID-, TI -, AU -, JT -, DP -, VI -, IP -, PG -, dan LID - untuk pengenal seperti DOI.

PubMed membuat file NBIB setelah memilih rekaman dan memilih Send to → Citation manager → Create file. Pengguna NCBI, perpustakaan, dan aplikasi seperti Zotero serta EndNote menggunakan format ini untuk bertukar metadata bibliografi. File NBIB dapat dibuka sebagai teks biasa, tetapi baris bertag di dalamnya tidak secara langsung valid sebagai BibTeX.

Apa itu format BIB

File .bib biasanya merupakan database BibTeX atau BibLaTeX yang berisi entri seperti @article{smith2024, ...}. BibTeX, BibLaTeX dengan Biber, JabRef, Zotero, Overleaf, dan banyak editor LaTeX dapat membacanya.

BibTeX menyimpan kolom terstruktur termasuk penulis, judul, jurnal, tahun, volume, halaman, DOI, URL, abstrak, dan kunci sitasi. Format teks biasa ini dapat dicari, diedit, dibawa ke berbagai sistem, dan terpisah dari dokumen yang menggunakannya untuk sitasi. Konversi dapat mempertahankan metadata, tetapi tidak dapat menambahkan artikel teks lengkap atau lampiran yang tidak ada.

Konversi dengan Zotero

1. Instal Zotero untuk Windows, macOS, atau Linux dari situs web resmi Zotero.
2. Buka File → Import, pilih file NBIB, dan pilih opsi impor MEDLINE atau PubMed jika Zotero meminta format. Gunakan All files dalam pemilih file jika .nbib tersembunyi.
3. Periksa rekaman yang diimpor, terutama nama penulis, judul, tanggal publikasi, rentang halaman, PMID, dan DOI.
4. Pilih item atau koleksi yang diperlukan, lalu pilih File → Export Library atau klik kanan pilihan tersebut dan pilih Export Items.
5. Pilih BibTeX atau BibLaTeX, pilih opsi catatan atau file yang diperlukan oleh alur kerja, lalu simpan hasil ekspor dengan ekstensi .bib.

Zotero biasanya merupakan metode lokal yang paling sederhana karena mengurai kolom PubMed bertag sebelum mengekspornya. Untuk metadata yang hilang, gunakan Add Item by Identifier milik Zotero dengan PMID atau DOI, lalu bandingkan rekaman pengganti tersebut dengan sumber PubMed sebelum mengekspornya. Ekstensi Better BibTeX menambahkan kunci sitasi yang dapat dikonfigurasi dan diulang serta ekspor otomatis, tetapi sifatnya opsional.

Gunakan Bibutils untuk konversi batch

Bibutils cocok untuk konversi lokal yang dijalankan dengan skrip atau dalam skala besar. Tahap MEDLINE-ke-XML dan XML-ke-BibTeX dapat digunakan sebagai pipeline:

med2xml references.nbib | xml2bib > references.bib

Instal Bibutils melalui package manager sistem operasi atau distribusi resminya. Periksa med2xml --help jika build yang terinstal memerlukan argumen input dan output secara eksplisit. Bibutils mungkin memetakan lebih sedikit kolom khusus PubMed dibandingkan Zotero, jadi periksa entri yang dihasilkan sebelum menggunakannya.

Opsi online untuk kumpulan kecil yang tidak sensitif

Untuk daftar referensi yang kecil, alat web PMID-to-BibTeX dari ZoteroBib atau Paperpile dapat mencari PMID dan menghasilkan BibTeX tanpa memerlukan aplikasi lokal. Layanan ini umumnya menerima PMID atau pengenal, bukan mengonversi file NBIB yang diunggah; tempelkan pengenal, ekspor BibTeX, lalu verifikasi hasilnya. Jangan unggah bibliografi pribadi, belum dipublikasikan, atau rahasia jika konversi lokal dapat dilakukan.

Periksa rekaman yang diekspor

• Beberapa rekaman NBIB tidak menyertakan DOI, edisi, halaman, abstrak, atau kolom tanggal publikasi yang lengkap. Pencarian DOI atau PMID dapat melengkapi kekurangan tersebut, tetapi metadata yang diambil tetap perlu dibandingkan dengan rekaman sumber.
• Pemformatan penulis PubMed dapat menghasilkan penulis perorangan atau korporasi yang keliru setelah konversi. Masukkan penulis korporasi dalam kurung kurawal tambahan, misalnya author = {{World Health Organization}}, lalu periksa nama keluarga, inisial, dan urutan penulis.
• Lindungi kapitalisasi yang harus tetap sama, seperti simbol gen, akronim, dan nama diri, dengan kurung kurawal BibTeX: title = {Effects of {DNA} repair}.
• Karakter Unicode, tanda pisah en, subjudul, nama beraksen, dan skrip non-Latin mungkin memerlukan dukungan UTF-8 dalam engine LaTeX, pemroses bibliografi, dan editor. Gunakan pdflatex dengan pengaturan encoding yang sesuai atau engine Unicode seperti XeLaTeX atau LuaLaTeX.
• Exporter yang berbeda menghasilkan kunci sitasi yang berbeda. Mengubah kunci setelah memasukkan sitasi dapat merusak referensi dalam file LaTeX yang sudah ada; gunakan kunci yang stabil sebelum menulis sitasi.
• Pertahankan PMID atau DOI dalam entri yang diekspor jika memungkinkan. Pengenal ini menyediakan cara yang andal untuk menemukan dan memperbaiki rekaman di kemudian hari.