Konverter online gratis NDPI ke JPG

Apa itu format NDPI

NDPI adalah format proprietary untuk whole-slide image yang dibuat terutama oleh scanner Hamamatsu NanoZoomer. Format ini dapat berisi gambar mikroskopi yang sangat besar dan multiresolution, yang digunakan dalam digital pathology, penelitian, dan pengarsipan slide.

Anda mungkin menemukan file NDPI dalam software Hamamatsu NDP.view2, QuPath, Fiji/ImageJ dengan Bio-Formats, dan aplikasi yang dibuat berdasarkan library OpenSlide. File NDPI dapat berukuran beberapa gigabyte dan mungkin mencakup beberapa level resolusi, sehingga format ini tidak setara dengan foto single-layer biasa.

Apa itu format JPG

JPG, yang juga disebut JPEG, adalah format gambar raster yang didukung secara luas dan menggunakan lossy compression. Format ini cocok untuk preview slide, laporan, presentasi, situs web, lampiran email, dan editing gambar umum.

File JPG biasanya jauh lebih kecil daripada file NDPI dan dapat dibuka tanpa software mikroskopi khusus. Format ini tidak mempertahankan pyramid NDPI, metadata khusus scanner, anotasi, multiple focal planes, atau data gambar diagnostik.

Cara benar-benar mengonversi NDPI ke JPG

Gunakan online converter

Anda dapat mengonversi file di 101convert.com secara gratis tanpa menginstal software. Upload file .ndpi, pilih JPG sebagai format output, mulai konversi, lalu download gambar yang dihasilkan. Untuk slide yang sangat besar, gunakan metode desktop atau ekspor region yang lebih kecil karena JPG beresolusi penuh dapat melebihi batas memory atau ukuran file.

Ekspor preview slide dengan OpenSlide dan Python

OpenSlide dirancang untuk membaca format whole-slide, termasuk banyak file NDPI. Instal system library OpenSlide untuk sistem operasi Anda, lalu instal Python bindings dan Pillow:

pip install openslide-python pillow

Simpan ini sebagai ndpi_to_jpg.py dan ganti nama file input:

import openslide

slide = openslide.OpenSlide("sample.ndpi")
image = slide.get_thumbnail((6000, 6000)).convert("RGB")
image.save("sample.jpg", "JPEG", quality=90, optimize=True)

Jalankan dengan:

python ndpi_to_jpg.py

get_thumbnail() membuat preview complete-slide dengan batas 6000 kali 6000 piksel. Tingkatkan dimensi tersebut untuk mendapatkan detail lebih banyak, tetapi periksa memory yang tersedia sebelum mengekspor gambar yang sangat besar.

Ekspor region beresolusi tinggi yang dipilih

Untuk area tissue yang harus mempertahankan lebih banyak detail, baca region pada pyramid level yang dipilih, alih-alih mengonversi seluruh slide:

import openslide

slide = openslide.OpenSlide("sample.ndpi")
region = slide.read_region((10000, 15000), 0, (4000, 3000)).convert("RGB")
region.save("region.jpg", "JPEG", quality=95)

Koordinat diukur dari sudut kiri atas pada level 0, yang biasanya merupakan resolusi tertinggi yang tersedia. Ubah lokasi dan dimensi agar sesuai dengan area tissue yang diperlukan. Koordinat level 0 dan level yang tersedia dapat diperiksa dengan slide.level_dimensions.

Gunakan QuPath atau Fiji

QuPath dapat membuka file NDPI yang didukung melalui OpenSlide. Buka slide, pilih view atau region yang diperlukan, lalu gunakan File → Export images untuk mengekspor JPG. Di Fiji/ImageJ, buka file melalui File → Open Samples atau importer Bio-Formats, lalu gunakan File → Save As → JPEG. Nama menu dapat berbeda menurut versi aplikasi dan plugin yang terinstal.

Quality, compatibility, dan limitations

Ekspor JPG bersifat lossy. Gunakan nilai quality sekitar 90–95 untuk penggunaan umum dan hindari membuka lalu menyimpan ulang JPG yang sama berulang kali. PNG atau TIFF lebih disarankan jika pixel-level analysis, anotasi, atau lossless preservation diperlukan.

JPG full-slide mungkin masih terlalu besar untuk beberapa viewer meskipun telah dikompresi. Mengekspor thumbnail atau region umumnya lebih compatible daripada meratakan seluruh slide menjadi satu gambar dengan resolusi maksimum.

Jangan gunakan JPG sebagai pengganti archival atau diagnostik untuk source NDPI. JPG menghilangkan struktur multiresolution dan dapat menimbulkan compression artifacts yang memengaruhi detail seluler halus. Simpan NDPI asli dan gunakan JPG sebagai salinan untuk presentasi atau sharing.