Konverter online gratis VSI ke PNG

Software mikroskop Olympus menyimpan whole-slide images dalam VSI, sementara banyak image editor, browser, dan sistem dokumentasi menerima PNG. Mengonversi file menghasilkan image raster yang portabel untuk dibagikan, diberi anotasi, digunakan di web, atau diedit secara dasar, tetapi image tersebut mungkin hanya merepresentasikan satu tampilan slide yang dipilih, bukan seluruh dataset multi-resolusi.

Apa itu format VSI

VSI biasanya berarti Virtual Slide Image, yaitu format proprietary untuk mikroskopi whole-slide yang dibuat oleh software Olympus seperti cellSens dan dilihat dengan OlyVIA. Format ini menyimpan imagery mikroskop pada beberapa resolusi, sering kali sebagai data tiled, bersama metadata akuisisi.

Dataset VSI dapat menyertakan file .ets terkait yang berisi data image. Simpan file .vsi dan file pendampingnya dalam folder yang sama; membuka file VSI saja dapat menghasilkan image yang tidak lengkap atau error missing-series. Jika ekstensi tersebut berasal dari software selain aplikasi mikroskopi Olympus, identifikasi sumbernya terlebih dahulu karena VSI bukan format universal dengan satu tujuan.

Apa itu format PNG

PNG adalah format raster lossless yang didukung secara luas. Format ini mempertahankan nilai piksel tanpa generation loss yang terkait dengan JPEG dan mendukung transparency, sehingga cocok untuk figures, screenshots, anotasi slide, presentations, dan halaman web.

PNG tidak mempertahankan struktur dataset VSI, metadata mikroskop, focus levels, atau resolution pyramid. PNG hasil konversi biasanya merupakan satu image plane yang dirasterisasi atau satu field of view yang dipilih.

Cara mengonversi VSI ke PNG

Menggunakan Fiji dan Bio-Formats

1. Instal Fiji, yang menyertakan importer Bio-Formats, dan simpan setiap file yang termasuk dalam dataset VSI di satu folder.
2. Mulai Fiji dan pilih File → Open, lalu pilih file .vsi. Jika Fiji meminta untuk menggunakan Bio-Formats, setujui.
3. Dalam Bio-Formats Import Options, pilih series yang diperlukan. Untuk file whole-slide, pilih resolution level atau region yang diinginkan, bukan memuat slide dengan resolusi maksimum jika memory komputer terbatas.
4. Untuk full image atau area yang dipilih, gunakan crop atau region-selection tools milik Fiji. Ubah display menjadi RGB melalui Image → Type → RGB Color jika output harus berupa PNG warna standar.
5. Pilih File → Save As → PNG dan simpan hasilnya dengan ekstensi .png.

Export PNG dari Fiji biasanya menyimpan image plane yang aktif. Jika import membuka stack, export slice yang diperlukan atau gunakan image-sequence workflow untuk beberapa plane; jangan berharap satu file PNG memuat stack VSI asli.

Menggunakan software Olympus

Buka dataset di OlyVIA atau cellSens, pilih magnification dan region yang diperlukan, lalu gunakan image export command aplikasi, yang biasanya terdapat di File → Export atau File → Save As. Pilih PNG dan atur export dimensions atau resolution sebelum menyimpan. Nama menu berbeda-beda di antara versi produk Olympus.

Mengonversi secara online

Anda dapat mengonversi file secara gratis di situs web 101convert.com tanpa menginstal software. Upload dataset VSI lengkap saat converter meminta file terkait; file .vsi yang berdiri sendiri mungkin tidak berisi semua piksel image. Konversi online tidak sesuai untuk data pasien atau data penelitian rahasia, kecuali ketentuan penanganan data situs tersebut memenuhi persyaratan Anda.

Keterbatasan kualitas dan kompatibilitas

Pilih output resolution dengan sengaja. Mengekspor overview beresolusi rendah menghasilkan PNG berukuran kecil, tetapi menghilangkan detail seluler yang halus; mengekspor whole slide beresolusi penuh dapat menghasilkan image yang sangat besar sehingga melampaui batas PNG, browser, atau aplikasi.

PNG mendukung data grayscale dan RGB 8-bit serta 16-bit, tetapi viewer biasa mungkin menampilkan image 16-bit secara tidak benar atau menurunkannya menjadi 8-bit. Untuk figures warna rutin, RGB PNG adalah pilihan yang paling kompatibel. Pertahankan file VSI asli jika metadata, calibration, z-stacks, multiple focal planes, atau pemrosesan ulang di masa mendatang penting.